خوشه بندی داده های بیان ژنی با استفاده از قوانین فازی
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده برق و کامپیوتر
- نویسنده مهرنوش سینایی
- استاد راهنما اقبال منصوری
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1391
چکیده
پیچیدگی شبکه های زیستی و تعداد زیاد ژ ن ها در مجموعه داده های ریز آرایه منجر به چالش های فراوان در زمینه تحلیل داده های بیان ژنی شده است. الگوریتم های خوشه بندی که ژن های مشابه یکدیگر را به هدف تحلیل عملکرد ژن ها گروه بندی می نماید اولین قدم برای رویارویی با این چالش ها می باشد. بطور کلی روش های خوشه بندی فازی برای تحلیل داده های بیان ژنی مناسب تر می باشند زیرا گروه های زیستی به طور ذاتی دارای هم پوشانی بوده و به میزان قابل توجهی نویز در آن ها مشاهده می شود. در همین راستا در این رساله از الگوریتم تولید قوانین فازی جهت خوشه بندی داده های بیان ژنی استفاده شده است که به صورت خودکار خوشه های نهفته در داده های بیان ژنی را بدون نیاز به دانش قبلی کشف کرده و با تولید قوانین فازی قابل تفسیر خوشه های کشف شده را به صورت قابل فهم برای انسان نشان می دهد. در پایان نیز میزان دقت الگوریتم پیشنهادی بر روی چند مجموعه داده ریز آرایه توسط چند معیار درستی بررسی شده و با چند روش خوشه بندی فازی شناخته شده مقایسه گردیده است.
منابع مشابه
طبقه بندی سنگ های ساختمانی از دیدگاه قابلیت برش با استفاده از روش خوشه بندی فازی
پیش بینی قابلیت برش سنگ به عنوان یکی از فاکتورهای موثر در تخمین هزینهها و پیش بینی میزان تولید یک کارخانه فرآوری سنگ از اهمیت بالایی برخوردار میباشد. بنابراین شناخت کامل سنگهای ساختمانی و ارزیابی توان اجرایی دستگاههای برش در کارخانههای فرآوری، طراحان و برنامهریزان تولید را به سمت بهبود سرعت فرآوری و افزایش تولید سوق میدهد. از اینرو، به کارگیری روشهای نو و کاربردی برای دستیابی به این اه...
متن کاملالگوریتم های خوشه بندی دوبعدی در داده های بیان ژنی: یک مطالعه مروری
در سال های اخیر تکنولوژی ریز آرایه امکان مشاهده و بررسی بیان هم زمان هزاران ژن را وقتی سلول تحت شرایط مختلف یا پروسه های متفاوت قرار می گیرد را فراهم کرده است و نقشی اساسی در سرعت بخشیدن و بالا رفتن کارایی مطالعات بیان ژنی ایفا می کند. یکی از مهم ترین تکنیک های تشخیص الگو در داده های بیان ژنی تحلیل خوشه بندی دوبعدی است که می تواند گروه هایی از ژن ها با الگو های بیان شده مشابه را بیابد. مطالعه ح...
متن کاملخوشه بندی داده های بیان ژنی و کاربرد آن در تحلیل افتراق انواع سرطان خون
سابقه و هدف: یکی از شاخه های مهم بیوانفورماتیک فناوری ریزآرایه dna است که امکان بررسی بیان هزاران ژن را به طور هم زمان در حداقل زمان ممکن می سازد که در سال های اخیر موجب تولید حجم انبوهی از داده های بیان ژنی شده است. تحلیل آماری این داده ها شامل نرمال سازی، خوشه بندی، طبقه بندی و ... از جمله روش های مورد استفاده در تحلیل این نوع داده ها است. مواد و روش ها: در این مقاله داده های بیان ژنی سرطان خ...
متن کاملنحوه خوشه بندی آماری داده های شکل
اخیرا به کارگیری ابزارهای آمار چندمتغیره برای تحلیل داده هایی که به صورت هندسی تصادفی هستند مورد اقبال محققین علوم کاربردی قرار گرفته است. آمارشکل به عنوان شاخه جدیدی از هندسه تصادفی شامل مجموعه ای از چنین داده هایی است. با این حال، چون چنین داده هایی ماهیت غیراقلیدسی دارند نحوه تطبیق ابزارهای مرسوم چندمتغیره برای تحلیل آماری مناسب آنها تا حدودی واضح نیست. در این مقاله نحوه خوشه بندی داده های آ...
متن کاملخوشه بندی داده های بیان ژنی توسط عدم تشابه جنگل تصادفی
زمینه و هدف: خوشه بندی داده های بیان ژنی در تشخیص و درمان سرطان، دارای اهمیت بسزایی است. مشخصه ی بارز این داده ها تعداد زیاد متغیرها (ژن ها) نسبت به تعداد داده ها (بیماران) است. بسیاری از روش های خوشه بندی بر پایه ی عدم تشابه داده ها که حاصل محاسبه ی یک تابع فاصله است، بنا شده اند و افزایش بعد، کارآیی توابع فاصله را کاهش می دهد. در این تحقیق معیاری جدید برای محاسبه ی عدم تشابه در ابعاد بالا...
متن کاملتحلیل و پهنه بندی فراوانی توفان های گرد و غباری ایران با استفاده از خوشه بندی فازی (FCM)
با توجه به اینکه گرد و غبار یکی از پدیده های جوی است که آثار و پیامد های زیست محیطی نامطلوبی نظیر تهدید سلامت عمومی، کاهش تولید و بهره وری اقتصادی، نارضایتی ساکنین و در نهایت مهاجرت اجباری در مناطق شهری و روستایی بر جای می گذارد، بنابراین هدف این بررسی، ناحیه بندی ایران از نظر فراوانی گرد و غبار های شدید و تعیین نواحی، استان ها و شهر های بحرانی کشور برای برنامه ریزی های ملی و بین المللی می باشد...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده برق و کامپیوتر
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023